Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms