Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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