Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms