Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHLA1C9JL84 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms