Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms