Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEURL1BA8MQ27 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms