Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYSRT1A8MQ03 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms