Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms