Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms