Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms