Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms