Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms