Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms