Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF8Q9UPP1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms