Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF18Q9UNG2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms