Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CIZ1Q9ULV3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CIZ1Q9ULV3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CIZ1Q9ULV3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CIZ1Q9ULV3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIZ1Q9ULV3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms