Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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