Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN11AQ9UI33 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms