Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2IRD1Q9UHL9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms