Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms