Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms