Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms