Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms