Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms