Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPF1Q9NWY4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPF1Q9NWY4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms