Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms