Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms