Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNPLA3Q9NST1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms