Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBQLN4Q9NRR5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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