Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms