Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms