Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms