Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CCT6P1-203ENST00000443108 1170 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL392023.2-201ENST00000554687 785 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL110292.1-201ENST00000550024 477 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms