Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms