Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms