Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms