Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms