Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D2Q9BYX2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBC1D2Q9BYX2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms