Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms