Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms