Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms