Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDC1Q9BTX1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms