Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms