Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms