Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM175Q9BSA9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms