Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms