Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms