Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms