Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms