Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms